Описание
Панель “Наследственные нарушения обмена веществ” включает анализ 566 генов связанных с большой группой наследственных заболеваний, затрагивающих расстройства метаболизма. Это гетерогенная группа болезней, при которых нормальные метаболические процессы в тканях нарушены, чаще всего из-за отсутствия или недостаточности определённого фермента, и, как следствие, патологического накопления веществ, обладающих токсическим действием или нарушающих способность синтеза других жизненно важных соединений. В большинстве случаев врожденные нарушения метаболизма проявляются в первые дни жизни. Однако, они могут остаться нераспознанными в период новорожденности, и диагноз может быть поставлен только через несколько месяцев и даже лет, или же в редких случаях дебютировать в более позднем возрасте.
В данную панель входят такие группы заболеваний как:
– нарушения обменов углеводов (например, болезни накопления гликогена),
– аминоацидопатии (например, фенилкетонурия),
– органические ацидурии (например, алькаптонурия),
– нарушения окисления жирных кислот (например, глютаровая ацидемия 2 типа),
– митохондриальные болезни (например, синдром Кернс-Сейера),
– порфирии (например, острая перемежающаяся порфирия),
– нарушение пуринов или пиримидинов (например, синдром Синдром Лёша-Найхана),
– нарушение обмена стероидов (например, врожденная гиперплазия надпочечников),
– пероксисомные болезни (например, синдром Цельвейгера)
– лизосомные болезни (например, болезнь Гоше),
– и другие заболевания со схожими проявлениями.
Виды генетических изменений, определяемых панелью “Наследственные нарушения обмена веществ”:
- Однонуклеотидные и мультинуклеотидные варианты (SNV и MNV) в экзонах всех клинически значимых генов;
- Малые вставки-делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов в экзонах всех клинически значимых генов;
- Вариации числа копий генов (CNV), такие как делеции/микроделеции и дупликации/микродупликации среднего и крупного размера (с ограничениями);
Метод исследования и его клиническая эффективность: Секвенирование нового поколения (NGS) со средним числом прочтений каждого участка генома не менее 70x (это означает, что каждый участок генома прочитывается в среднем не менее 70 раз для снижения влияния технических ошибок сиквенса на результаты исследования). При секвенировании генов, включенных в панель “Наследственные нарушения обмена веществ” , вероятность обнаружения причины заболевания составляет 20-45% .
Ограничения метода: Метод не выявляет генетические варианты в повторяющихся вариантах генома (гены, имеющие псевдогены, паралоги, сегментарные повторы). Точность метода, также снижена в сложных участках генома (GC богатые и poly-n участки).