Описание
Секвенирование генома – определение всей последовательности ДНК в ядре клетки и в митохондриях. На сегодняшний день это самое полное генетическое исследование, которое выявляет максимальное количество возможных генетических изменений, которые могут быть причиной генетического заболевания. Проведение полногеномного секвенирования трио повышает его эффективность, по сравнению с аналогичным исследованием, проведенным только пробанду. Такой подход позволяет правильно классифицировать ранее не описанные варианты, варианты в генах кандидатах и значительно сокращает время постановки точного диагноза. Кроме того, проведение полногеномного секвенирования позволяет определить у родителей носительство патогенных мутаций, связанных с аутосомно-рецессивными заболеваниями и болезнями с поздним началом.
Виды генетических изменений, определяемых полным секвенированием генома:
- Однонуклеотидные и мультинуклеотидные варианты (SNV и MNV);
- Малые вставки-делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов
- Вариации числа копий генов (CNV), такие как делеции/микроделеции и дупликации/микродупликации различного размера;
- Участки потери гетерозиготности и однородительские дисомии;
- Варианты в митохондриальном геноме с детекцией гетероплазмии >5%;
- Сбалансированные хромосомные изменения с определением точек разрыва (с ограничениями);
- Экспансия тандемных повторов в 37 генах (с ограничениями).
В отличии от других исследований полное секвенирование генома определят наличие всех вариантов не только в кодирующих областях генома (экзонах) но и в некодирующих (интроны, нетранслируемые регионы, межгенные участки) на которые приходится до 5% патогенных генетических вариантов.
